Det var vid planeringen av de nya fängelserna till Haparanda och Östersund som kritiken uppkom.
Riksrevisionen kritiserade Kriminalvården för slöseri med skattemedel och högt uppsatta inom Kriminalvården anklagas för mutbrott.
Misstankarna om mutbrott har föranlett en omfattande polisutredning som inleddes för omkring ett år sedan.
Nu har Kriminalvården gjort en egen analys och underkänner Riksrevisionens arbete.
Det är Kriminalvårdens avtal med arkitektkontoret Fojab som dragit till sig uppmärksamhet. Kriminalvården anser att utbetalningarna till konsulterna var befogade.
Tre punkter
Riksrevisionen är kritiska till bristande dokumentation av förhandlingar och ställningstagande, bristande underlag för tilläggsfakturering och återstående arbete och tveksamma extrakostnader orsakade av avbeställningen.
Kriminalvården anser att slutregleringsavtalet hölls inom förhandlingsutrymmet. Kriminalvården anser att eftersom slutregleringsavtalet undertecknats var det accepterat och därmed hade tankegångarna hos förhandlaren "underordnad roll", skriver de i sitt utlåtande.
Missuppfattning
Vad gäller bristande tilläggsfakturering anser Kriminalvården att det skett en missuppfattning och tillbakavisar kritiken från Riksrevisionen med att de har haft full tillgång till samtliga dokument och till en gemensam digital projektdatabas.
Kriminalvården uppger att protokollföring har skötts av Fojab och att Kriminalvården har granskat information och om fel hittats har de rättats till.
Vad gäller muntliga beslut beror de enligt Kriminalvården på behov av snabbhet för att driva projektet framåt.
Vid slutuppgörelsen har arbetet försvårats då "centrala personer" för projekten varit brottsanmälda. Kriminalvården anser att "de personer som företrätt Kriminalvården har utfört uppdraget väl".
Kriminalvården uppger att kostnader har varit styrkta.
Fojab har betalat tillbaka 6,3 miljoner kronor exklusive moms till Kriminalvården vid avbeställning av projekten.
Men Riksrevisionens arbete har lett till att Kriminalvården inlett vidgad dokumentation, där även bakgrund till beslut finns med.