Händelserna är från den 10 juli år 2017 och en by i Kalix kommun.
Mannen ska ha skickat ett meddelande till Anders Ygeman på dennes sida på Facebook. Han ska bland annat ha uttryckt en önskan om att ministerns familjemedlemmar ska våldtas.
Mannen ska också ha skickat ännu ett meddelande som inleds med att Anders Ygeman ska ta statsministern i hand och lämna landet för ”ni är båda två lika ynkliga så kallade ledare”.
Meddelandena har uppfattats som hänsynslösa.
Nationella åklagaravdelningen, riksenheten för säkerhetsmål, står bakom stämningsansökan.
Förhandlingen i tingsrätten är i november.