Förbundskaptenen Didier Deschamps säger att skälet var att han inte ville ta några risker med Real Madrid-anfallaren.
Benzema har inte tagits ut till landslaget sedan 2015 på grund av skandalen med hans påstådda inblandning i en utpressning kopplat till en sexvideo med den tidigare franska landslagskollegan Mathieu Valbuena.
Frankrike vann matchen med 3–0. Antoine Griezmann cykelsparkade in ett mål och inhopparen Olivier Giroud satte två mål.