De två första perioderna i Lombiahallen var målmässigt jämna.
I den tredje perioden gick Kiruna IF dock ifrån.
Simon Thyni satte 4–3 på pass från Hampus Hagström efter fyra minuter.
Tre minuter senare spelade Jacob Hansson Geidon fram Teemu Siironen som gjorde 5–3.
En utvisning som Markus Magnusson drog på sig när det återstod sju minuter av perioden gjorde det möjligt för Joshua Laframbouise att reducera för Nyköping.
Men när tränaren Björn Olsson med två minuter kvar tog ut målvakten punkterade Hampus Hagström matchen.
Under söndagen gästas Kiruna IF av mittenlaget Hanviken.
Matchfakta
Kiruna IF–Nyköping 6–4 (2–2, 1–1, 3–1)
Målen, Kiruna: Hampus Hagström 2, Jacob Hansson Geidon, Svante Koivuniemi, Simon Thyni, Teemu Siironen.