En stor klunga höll ihop länge och Nilsson, trea totalt i Tour de Ski, var starkare än alla andra på slutet och tjänade in 15 viktiga bonussekunder.
Jessica Diggins, USA, blev tvåa medan norskan Heidi Weng blev trea. Ingvild Flugstad Østberg, som ledde Tour de Ski inför etappen, blev inte bättre än 13:e.
Även Charlotte Kalla fick ett skönt besked i Oberstdorf. Efter en tung start på touren slutade Kalla åtta.